'레고 스토어'는 일반 레고 판매점과 비교해 세 가지 차별화 요소가 존재한다. 우선, 스토어 내부 인테리어와 디자인이 레고가 지정한 디자인에 따라 꾸며진다. 스토어 천장에는 레고 브릭을 연상시키는 조명이 달려있고, 모든 레고 전시물 위에는 전시물과 동일한 제품이 전시된다.
또 만들어진 레고 전시물은 모두 아이들의 눈높이에 맞춰 아이들이 레고를 자세히 볼 수 있도록 했다. 레고 마니아들이 생각하는 가장 큰 차별점은 '픽어브릭(Pick A Brick) 존'이다. 픽어브릭 존은 소비자가 레고 브릭을 규격화된 용기에 원하는 만큼 담아 구입할 수 있는 곳으로, 백화점 '캔디바' 같이 필요한 레고 브릭 부품을 마음껏 고를 수 있다는 것이 장점이다.
레고 스토어에서는 '레고 피규어'도 자신의 취향대로 꾸미고 만들어 구입할 수 있다. 레고 커스텀 피규어존에서는 머리, 헤어, 몸통, 다리로 나뉘어진 레고 피규어 부품을 조합해 자신만의 레고 피규어를 완성할 수 있으며, 스토어에서 만든 레고 피규어는 3개 1세트 단위로 구입할 수 있다.