국방부 소속 군장병과 공무원, 군무원은 10%의 운임 할인 혜택이 제공된다. 단, 탑승 당일에 복지카드나 국가보훈처 발행 신분증, 군인신분 증명서 등 증빙서류를 소지해야 한다. 이번 국내선 할인제도는 발권일 기준으로 6월 20일부터 시행된다. 진에어 홈페이지와 고객서비스센터, 공항 등에서 항공권 구매 시 할인 혜택을 적용된다.
한편, 진에어는 김포~제주, 부산~제주, 청주~제주 노선에 이어, 6월 30일부터 광주~제주 노선에 취항해 총 4개의 국내선을 운영할 예정이다.
